Свое имя город получил от угофинского племени «весь», которого когда-то селилось здесь, и финского слова «йогги» (река), что означало «весь речная». Впервые официально упоминается Весьегонск в XV в., как село Весь Егонское. До 1764 г. село принадлежало Московскому Симонову монастырю, было крупным пунктом торговли.

В XVI в. славилось крупнейшими ярмарками, на которые съезжались не только купцы новгородские, московские, тверские, суздальские, нижегородские, астраханские, но и персидские, арабские и другие иноземные купцы. Весьегонская Богоявленская ярмарка была самой значительной в Тверской губернии вплоть до конца XIX в.

Советская власть была установлена в городе в январе 1918 г. В 1926 г. весьегонцы построили железную дорогу.

В годы войны 14,5 тыс. весьегонцев ушли на фронт, 6280 из них не вернулись. Их имена внесены в книгу памяти.

Сегодня Весьегонск и район стал излюбленным местом рыболовов, грибников, туристов, приезжающих сюда летом москвичей, тверитян и других. Светло-синие волны самого крупного в Европе Рыбинского моря плещутся у самых городских улиц. Вечнозеленые сосновые боры со всех сторон окаймляют город, водохранилище и полноводные реки района.